肠道健康与宿主的健康和生产繁衍息息相关，肠道健康依赖于宿主与菌群以及菌群间的互作和共进化，并通过宿主基因组和菌群基因组的协调作用来维持不同环境条件下的机体健康。因此，将基于遗传的（选择和育种）和基于管理的（精确喂养计划）方法相结合，以实现最佳的宿主-微生物交互作用，从而提高家畜的生产力，以应对正在出现的全球粮食安全、生态环境破坏的挑战，是非常重要的。所以，结合宿主基因组和肠道微生物基因组的家畜遗传改良成为家畜未来选育提高和高效饲养管理的主要发展方向。
通过对不同年龄（2岁和3岁）犏牦牛瘤胃微生物宏基因组测序发现，两个年龄犏牦牛瘤胃内的微生物群落组成基本相似且趋于成熟稳定。通过基因功能注释发现，高原成年犏牦牛瘤胃内含有大量的木质纤维素降解微生物和一些重要的酶系，以及一些与高原适应性相关的微生物群落。该项成果以论文“Characteristics and Functions of the Rumen Microbial Community of Cattle-Yak at Different Ages”发表在《BioMed Research International》期刊上，由刘秀、沙玉柱、胡江等共同完成。
这是重点实验室在牛羊肠道微生物组领域取得的第一项研究成果，将作为进一步探索高原动物肠道微生物区系和功能基因的基础研究依据。将来还将继续探讨牦牛冷季育肥肠道微生物变化特征、藏绵羊肠道miRNA-微生物组互作模式等，为高原动物生产提供理论指导。
